球囊在医学上有广泛的应用，除常用球囊扩张狭窄的血管，包括外周血管和冠状动脉，也可利用球囊的扩张作用治疗其它一些器官的狭窄病变，比如鼻窦，泪道，唾液管，食道，胆道，尿道狭窄等，还可以利用球囊压迫止血，如产后出血，宫腔出血，胆道， 尿道，胃底食道下端出血等。此外也有球囊固定胃管，导尿管，器官切开插管以及利用球囊做锥体成型的应用。
球囊技术在妇产科应用较多，除子宫颈扩张球囊导管（用于促进宫颈成熟）和球囊子宫支架（用于产后宫腔压迫止血）外，还有一种三角球囊子宫支架，该产品临床用于子宫宫腔手术、刮宫术后的宫内放置，以减少子宫内出血和防止黏连。其作用机理见下图：
三角球囊子宫支架的主要由硅胶制成；该材料在临床上已广泛应用，没有发现不良现象。需要提及的是该产品需要专业医生使用，充盈球囊可用生理盐水，根据不同的型号（三角球囊直径3cm左右），仅需充盈5-8ml即可，不可使用气体充盈球囊。
球囊子宫支架一般是在宫腔镜下放置。目的不同，放置的时间长短各异，如果目的仅仅是压迫止血，那么等到血止住了以后就可以取出了。如果是为了防止宫腔黏连，放置的时间可能7-10天或更长，比如行宫腔黏连分离时，分离面较大，为避免术后再次粘连，手术结束时需要放置球囊支架。其他如子宫纵隔切除或者是大的粘膜下肌瘤、子宫内膜息肉切除之后，宫腔内创面比较大，考虑术后可能形成宫腔黏连的，也有可能放置球囊支架。
该产品禁用于怀孕，宫颈癌，阴道，宫颈或子宫的化脓性感染等情况。
气管切开插管上也带有一球囊，见下图：
该球囊有下列作用：
1. 固定气管切开插管。
2. 防止咽喉部或上呼吸道分泌物以及切口处出血流入肺部。
3. 正压通气时，起密闭作用，保证气体进入肺部。
其它应用举例